新生儿病毒感染的病原有巨细胞病毒、风疹病毒、疱疹病毒、肝炎病毒、肠道病毒（Cixsackie，Echo病毒）、Epstein-Barr病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒、轮状病毒、人类免疫缺陷病毒（爱滋病毒）等，最常见的是巨细胞病毒。
感染的主要方式有：
1、宫内感染 可发生于妊娠各个时期。通过下列途径：①孕母病毒血征，病毒经胎盘，越过胎盘屏障通过血流到达胎儿；②子宫内膜炎和/或附件感染，胎盘病毒炎症，病毒在局部复制繁殖，而后经血液、淋巴循环或污染了羊水感染胎儿；③阴道病毒感染的上行感染，尤其在早期破膜后。
2、经产道分娩时 一些妇女在产道带有病毒，对机体本身无害，但却长期排病毒，污染了产道分泌物。妊娠期病毒排出率可能增高。胎儿经产道娩出时或有宫内窘迫时易吞入污染的分泌物或带病毒产母的血而受染。
3、出生后 通过奶母及护理人员的手、飞沫、用具、衣物、乳汁或与病人接触或医源性（如输血）等受染。与携带病毒母亲的密切接触最为重要。
上述三种感染方式中以宫内感染为主要。宫内感染是造成死胎、流产、先天畸型、新生儿急性病毒感染或慢性潜伏感染的重要原因。
许多不同的病毒可引起同样临床表现，有全身及局部感染的症状。宫内感染者可有流产、死胎、早产及宫内发育迟缓。全身症状与细菌性败血症相似如发热、黄疸及肝脾肿大。按某一病毒的趋向性而突出某一器官或系统的症状，如间质性肺炎、心肌炎或脉络膜视网膜炎。局部症状如小眼球、白内障、青光眼、小头、小下颌等畸型、皮肤疱疹、斑丘疹等。
近年来虽然抗病毒化疗的研究进展迅速，但除少数外大多数仍处于实验观察阶段，从目前仅有的报道说明病毒引起的疾病是可以治疗的。目前仍然是以对症治疗为主。一般治疗包括加强护理，对症处理，免疫球蛋白的应用。伴细菌感染时短期使用抗生素。目前抗病毒药物种类繁多，但在新生儿期应用的尚少。如疱疹净（只宜用0.1%溶液），干扰素（用量大可引起肝肾及肺疾病），阿糖腺苷、无环鸟苷等。
